Samaan aikaan, jotta näitä infektioita kärsiviä ei jätettäisi onneensa - puhumme tässä voimakkaista polttavista tunteista sekä vatsan ja lantion painon tunteesta, joita seuraa jatkuva tarve virtsata - lääkärit määräävät heille sokkona laaja-alaisen antibiootin toivoen, että onni olisi heidän puolellaan.
E. coli -bakteeri on yksi tärkeimmistä syistä virtsatulehduksiin ihmisillä. Kuvassa E. coli -bakteereja (vaaleanpunaisina) kiinnittyneenä hiiren rakkoon (sinisenä) hyökkäävät valkosolut (keltaisina).
Valerie O'Brien, Matthew Joens, Scott J. Hultgren, James A.J. Fitzpatrick, Washingtonin yliopisto, St. Louis
"Ei ainoastaan tämä toimintatapa voi olla tehoton taudinaiheuttajaa vastaan, vaan se tunnetaan myös antibiooteille resistenttien bakteerikantojen syntymisen edistämisestä", toteaa Arnaud Droit, Lavalin yliopiston lääketieteellisen tiedekunnan professori ja Quebecin CHU:n tutkimuskeskuksen tutkija.
Viime vuosina professori Droit ja hänen tiiminsä ovat työskennelleet testin kehittämiseksi, joka mahdollistaisi virtsatietulehduksen aiheuttavan bakteerin tunnistamisen nopeammin ja siten oikean antibiootin määräämisen viipymättä. Heidän lähestymistapansa, joka on kuvattu äskettäin julkaistussa Molecular & Cellular Proteomics -lehdessä, yhdistää proteomiikan ja tekoälyn.
Heidän tutkimuksensa on keskittynyt 15 bakteerilajiin, jotka aiheuttavat 84% kaikista virtsatietulehduksista. Massaspektrometrin avulla tiimi on kvantifioinut kunkin lajin osalta 82 peptidin (proteiini-fragmenttien) runsauden, mikä mahdollistaa jokaiselle lajille ominaisen allekirjoituksen määrittämisen. Vertailtaessa näitä allekirjoituksia potilaan virtsanäytteessä olevien bakteerien allekirjoituksiin, on mahdollista tunnistaa virtsatietulehduksen aiheuttava bakteeri. "Tämän lähestymistavan ansiosta bakteerin tunnistamiseen kuluva aika on alle neljä tuntia", tarkentaa professori Droit.
Tutkimusryhmä on testannut tämän nopean testin luotettavuutta 70:llä virtsatietulehduksesta kärsivällä henkilöllä. Nopean testin avulla saatu diagnoosi on verrattu tällä hetkellä Quebecissä käytettävään menetelmään. "Tulokset ovat yhdenmukaisia 87%:ssa tapauksista. Tämä suorituskyky olisi riittävän korkea, jotta nopeaa testiä voitaisiin harkita käytettäväksi kliinisessä ympäristössä", arvioi professori Droit. Lisäksi sen tehokkuutta voitaisiin parantaa lisäämällä enemmän peptidejä kunkin bakteerin allekirjoitukseen.
Nyt on vielä löydettävä keino siirtää tämä menetelmä tutkimuslaboratoriosta kliiniseen ympäristöön. "Olemme kehittäneet tämän testin tutkimusvälineiden avulla, joita ei ole saatavilla klinikoilla ja sairaaloissa", korostaa professori Droit. "Teemme yhteistyötä tieteellisten instrumenttien valmistusyrityksen kanssa mukauttaaksemme menetelmän yksinkertaistettuihin versioihin, joita voidaan käyttää kliinisessä ympäristössä."
Muut Molecular & Cellular Proteomics -lehdessä julkaistun tutkimuksen allekirjoittajat ovat Clarisse Gotti, Florence Roux-Dalvai, Ève Bérubé, Antoine Lacombe-Rastoll, Mickaël Leclercq, Maurice Boissinot ja Michel G. Bergeron Lavalin yliopistosta, sekä Cristina C. Jacob, Claudia Martins ja Neloni R. Wijeratne Thermo Fisher Scientificilta San Josessa, Kaliforniassa.